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          SILAC-細胞差異蛋白質組分析服務

          SILAC-細胞差異蛋白質組分析服務

          型號:   更新時間:2023-10-23

          簡要描述:

          SILAC-細胞差異蛋白質組分析服務 在細胞的增殖過程中,穩定同位素標記的K和R自然“摻入"到蛋白質中,從而在細胞中所有的蛋白質上引入了質量標簽(Mass Tag,3-10Da)。

          品牌上海創凌供貨周期現貨
          應用領域醫療衛生,環保,化工,生物產業,農業

          、SILAC-細胞差異蛋白質組分析服務簡介

          SILAC(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)是基于哺乳動物細胞生長對“必需氨基酸”的依賴原理,將穩定同位素(13C、15N)標記的Lys(K)和Arg(R)加入細胞培養基中對細胞進行培養。在細胞的增殖過程中,穩定同位素標記的K和R自然“摻入”到蛋白質中,從而在細胞中所有的蛋白質上引入了質量標簽(Mass Tag,3-10Da)。借助后續MS的高分辨率,在MS層面上,實現對蛋白質水平進行高精度定量的技術。

          SILAC技術基本的應用是做細胞/細胞亞組分(細胞質、細胞核、線粒體、外泌體等)的各種蛋白質表達差異譜分析。此外,(1)使用SILAC技術標記小鼠、酵母、大腸桿菌、果蠅、線蟲等模式生物,從而可以借助MS直接定量比較動物個體的蛋白質組差異(SILAM);(2)利用SILAC技術,借助細胞株,通用可以分析人體的不同組織的蛋白質表達譜差異(super-SILAC);(3)SILAC結合IP-MS(免疫沉淀-質譜)可定量分析蛋白質互作/翻譯后修飾的定量分析(SILAC+IP-MS)。

          SILAC技術的優勢體現在(1)直接通過細胞代謝,實現對整個細胞蛋白質組的標記,從實驗的源頭引入質量標簽(Mass tag),實驗的系統誤差顯著降低;(2)實驗步驟簡單,只要將SILAC標記的和非標記的蛋白質1:1混合,就能進行后續MS分析;(3)定量準確度更高,定量信息豐富。

          二、SILAC-細胞差異蛋白質組分析服務服務方案

          (一)整體服務:

          只需客戶提供細胞即可,我方負責完成:

          SILAC培養基制備。

          細胞SILAC標記及標記效率MS檢測;

          SILAC標記細胞與非標記細胞擴增;

          蛋白質提取、分離(SDS-PAGE)及染色;

          切割條帶,分別進行LC-MS測試;

          MS數據分析,完成蛋白質的鑒定及定量分析,篩選差異表達蛋白;

          差異表達蛋白常規生物信息學分析;

          我方同樣有技術實力進行具體蛋白質(經用SILAC實驗篩選、驗證后的蛋白)的功能實驗。如有需求,方案另議。

          (二)合作共贏方案:

          原則是通過協商簽訂合同,雙方各完成一部分實驗內容。

          客戶方需從我方購買相應的SILAC培養基及耗材。我方提供細胞SILAC標記的實驗方案,協助客戶完成細胞的SILAC標記過程。

          標記完成后,需用LC-MS鑒定細胞標記效率。該步驟需交由我方完成鑒定。

          正式實驗的蛋白質樣品,需交由我方完成MS鑒定和定量分析。

          三、其他特色:

          SILAC培養基。我方能生產多種類型的SILAC培養基(K6R6、K4R6、K6R8、K8R10等),7-10個工作日發貨,免去客戶從國外進口SILAC培養基及其標記氨基酸的漫長貨期。

          SILAC培養基,500ml起訂。

          我方同時銷售SILAC相關的試劑/耗材(dialyzed FBS,filter等),歡迎咨詢。

          四、客戶發表的代表性論文:

          Analytical chemistry 2017, 89(19):10248-10255. 

          Analytical chemistry 2017, 89(21):11468-11475.

          Journal of proteome research 2013, 12(5):2055-2066.

          Amino acids 2014, 46(4):841-852.


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